求问:分子生物学中Contig的含义?

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contig就是重叠群的意思。就是基因组分析测序中的一个概念。

把含有STS序列标签位点的基因片段分别测序后,重叠分析就可以得到完整的染色体基因组序列 。分析中的用到的一个概念就是重叠群。

物理图谱的制作 ,可以更好的理解这个概念:

基本原理是把庞大的无从下手的DNA先“敲碎”,再拼接。以Mb 、kb 、bp作为图距,以DNA探针的STS(sequence tags site)序列为路标 。1998 年完成了具有52,000个序列标签位点(STS) ,并覆盖人类基因组大部分区域的连续克隆系的物理图谱。构建物理图的一个主要内容是把含有STS对应序列的DNA的克隆片段连接成相互重叠的“片段重叠群(contig) ”。用“酵母人工染色体(YAC)作为载体的载有人DNA片段的文库已包含了构建总体覆盖率为100%、具有高度代表性的片段重叠群 ”,近几年来又发展了可靠性更高的BAC、PAC库或cosmid库等 。

Git是一个分布式的版本控制系统,最初由Linus Torvalds编写 ,用作Linux内核代码的管理。在推出后,Git在其它项目中也取得了很大成功,尤其是在Ruby社区中。目前 ,包括Rubinius 、Merb和Bitcoin在内的很多知名项目都使用了Git 。Git同样可以被诸如Capistrano和Vlad the Deployer这样的部署工具所使用。

作为开源代码库以及版本控制系统,Github拥有140多万开发者用户。随着越来越多的应用程序转移到了云上,Github已经成为了管理软件开发以及发现已有代码的首选方法[2]  。

如前所述 ,作为一个分布式的版本控制系统 ,在Git中并不存在主库这样的概念,每一份复制出的库都可以独立使用,任何两个库之间的不一致之处都可以进行合并 。

GitHub可以托管各种git库 ,并提供一个web界面,但与其它像 SourceForge或Google Code这样的服务不同,GitHub的独特卖点在于从另外一个项目进行分支的简易性。为一个项目贡献代码非常简单:首先点击项目站点的“fork”的按钮 ,然后将代码检出并将修改加入到刚才分出的代码库中,最后通过内建的“pull request”机制向项目负责人申请代码合并。已经有人将GitHub称为代码玩家的MySpace 。

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  • 啦中侮的头像
    啦中侮 2025年09月21日

    我是幺幺号的签约作者“啦中侮”

  • 啦中侮
    啦中侮 2025年09月21日

    本文概览:近期关于求问:分子生物学中Contig的含义?的讨论热度持续攀升,我们通过多方渠道收集整理了相关资讯,并进行了系统化的梳理。若这些内容恰好能为您提供参考,将是我们最大的荣幸。c...

  • 啦中侮
    用户092109 2025年09月21日

    文章不错《求问:分子生物学中Contig的含义?》内容很有帮助